Более 10 лет была ведущей актрисой легендарного театра-кабаре «Летучая мышь» Григория Гурвича (спектакли «Я степую по Москве», «100 лет кабаре», «Это — шоу-бизнес», «Вам позволено переиграть»); в спектакле «Великая иллюзия» исполняла арии из мюзиклов «CHICAGO» (Велма), «Сансет Бульвар» (Норма Дезмонт), «Призрак Оперы» (Карлотта), «HelloDolly» (Долли).

В творческой биографии Елены Чарквиани заглавные и запоминающиеся роли в самых громких постановках мюзиклов на московской сцене. Среди них: Миссис Чайтон в «Красавице и Чудовище», Гризабелла в мюзикле «Кошки», удивительная Мать Настоятельница из «Звуков Музыки». Дерзкая и страстная Мама Мортон в мюзикле «Чикаго». Загадочная и завораживающая мадам Жири в мюзикле «Призрак Оперы». Фея-крёстная в «Золушке». Великолепная Донна в мюзикле «MammaMia».