Окончил Школу-студию МХАТ (курс Василия Маркова) в 1991 году.

В 1990 году от Школы-студии МХАТ стажировался в Оксфорде (Англия).

С 1993 по 1997 г. — актер театра «Современник», играл в спектаклях: «Анфиса», «Три сестры», «Кот домашний средней пушистости», «Виндзорские насмешницы» и др.

В 2000 году окончил Высшие курсы сценаристов и режиссёров, (мастерская Владимир Хотиненко).

Его первая режиссерская работа — спектакль «Малые супружеские преступления» Э.Э. Шмитта в Русской антрепризе им. А. Миронова (Санкт- Петербург) — номинант театральной премии «Золотой софит».

Сегодня – он автор постановок в крупнейших московских театрах:

МХТ им. Чехова — «Крейцерова соната» Л. Толстого и «Дуэль» А. Чехова;

Et Cetera — «Драма на охоте» А. Чехова;

Малый театр — «Священные чудовища» Ж. Кокто и «Село Степанчиково и его обитатели» Ф.М. Достоевского;

РАМТ — «Гупёшка» В. Сигарева и «Соглядатай» М. Панича.

В 2010 году за спектакль «Дуэль» Антон Яковлев награжден Золотым дипломом Международного театрального форума «Золотой Витязь» за лучшую режиссёрскую работу и инсценировку прозы А. Чехова.

В Театре имени Евгения Вахтангова в 2007 году был автором инсценировки и режиссёром-постановщиком спектакля «Мелкий бес» по роману Ф. Сологуба.

Новая работа Антона Яковлева в Вахтанговском театре – спектакль «Подросток» — будет приурочена к открытию новой сцены в 2015 году.

В 1983 году дебютировал в кино  фильмом «Человек из страны Грин».

Снимался в фильмах: «Машенька» — 1991 «Три августовских дня» — 1992 (США/Россия) «Миссис Ли Харви Освальд» — 1993 (США) «Петербургские тайны» 1995 «Перевоплощения Богарта» 2001 и др. Автор сценария и режиссер фильмов: «Чужая игра», 1999 (Мастер-класс Кшиштофа Занусси, Польша) «Поздний визит», 2001 «Казалось бы?», 2003 В 1999 году работал на телевидении — ведущий программы «Кинопанорама».